作业帮分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?已知鹌鹑的某基因序列了,不是fasta格式,并从EMBL中下载了其他物种该基因的fasta格式数
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/17 01:32:43
分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?已知鹌鹑的某基因序列了,不是fasta格式,并从EMBL中下载了其他物种该基因的fasta格式数
分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?
已知鹌鹑的某基因序列了,不是fasta格式,并从EMBL中下载了其他物种该基因的fasta格式数据,怎样BLAST对比同源性,我从SWISS-PROT下载了蛋白序列fasta格式的,但是不知道怎么预测等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构,如何比对.急求高人指点一二.还有,PCR退火温度是不是引物Prime软件设计图上那个Tm.
分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?已知鹌鹑的某基因序列了,不是fasta格式,并从EMBL中下载了其他物种该基因的fasta格式数
对比同源性一般不是用BLAST,而是用DNA alignment. 可以用软件MEGA. 有序列了做一个fasta还不容易吗?建一个txt文件,写入下面类似的东西：
>your gene name and other stuff
atttcccctgggg
这就是fasta格式.
“预测等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构”,这么复杂的东西,不是在知道上问问就能找到答案的.多在google上搜索一下,记得是google,不是百度.搜索什么什么 prediction,应该有相应的软件或网站的.科研不是“急求”就能求到的,不懂的东西多半还是要靠自己搜,没有人知道得那么全面.
PCR退火温度需要比Tm低一些,但是Tm会根据条件不同而变化,所以还是自己试出来的.退火温度高一点,会提高特异性,但也可能P不出来,一切看你的目的.多试.