PCR扩增16sRNA怎么扩?我有几株菌,想初步对其进行种属的鉴定.我拿到的材料上要求分别提基因组DNA后,用PCR扩增其16sRNA,.怎么扩?我看到文献上都是扩16SrDNA的步骤,但没有扩16sRNA的步骤.本人菜鸟,
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/10/06 21:00:45
PCR扩增16sRNA怎么扩?我有几株菌,想初步对其进行种属的鉴定.我拿到的材料上要求分别提基因组DNA后,用PCR扩增其16sRNA,.怎么扩?我看到文献上都是扩16SrDNA的步骤,但没有扩16sRNA的步骤.本人菜鸟,
PCR扩增16sRNA怎么扩?
我有几株菌,想初步对其进行种属的鉴定.我拿到的材料上要求分别提基因组DNA后,用PCR扩增其16sRNA,.怎么扩?我看到文献上都是扩16SrDNA的步骤,但没有扩16sRNA的步骤.本人菜鸟,
另外我补充一个弱弱的问题,既然是要扩16sRNA,为什么要提取基因组总DNA呢?而16sRNA不是在核糖体里面吗?另外既然扩的是RNA,但我看文献里面都是模板DNA,TaqDNA聚合酶等跟DNA有关的事情。没看出来是要扩16s 但我真的不太清楚。真是困惑了.....
PCR扩增16sRNA怎么扩?我有几株菌,想初步对其进行种属的鉴定.我拿到的材料上要求分别提基因组DNA后,用PCR扩增其16sRNA,.怎么扩?我看到文献上都是扩16SrDNA的步骤,但没有扩16sRNA的步骤.本人菜鸟,
可怜孩子,被无数人忽悠.
首先,既然是16s,那我判断你要做原核微生物的菌种鉴定,对么?真核用的是18s……
99%的微生物菌种鉴定,都是扩增rDNA测序,从来没有听说什么扩RNA的,RNA那么不稳定,还能经得起PCR那么折腾?要扩增RNA的信息,也得先把RNA反转录成cDNA才能PCR.
然后,那东西叫做:16s rDNA,意思是,16s那么大的一个核糖体DNA亚基,你一定是看错了,那个“r”的意思是核糖体,不是RNA.
总之,你按照文献提取基因组,做16srDNA的扩增就行了,忘了你那什么RNA吧
首先你需要把你的RNA做反转录,把它转成cDNA,这里面的引物需要你自己设计~其中反转录有专门的试剂盒,为什么要把RNA转录成cDNA呢?因为RNA不稳定很容易被环境中的RNA酶降解,所以要转换成cDNA,做PT-PCR通过最后可以计算出你初始RNA含量。
先提 RNA 然后 是RT 最后 用设计的16s dna 引物扩 就行了
16SRNA文献很多阿,你肯定没有好好找。我给你GOOGLE了一下:最后那篇是说菌种鉴定的。
http://aem.asm.org/cgi/reprint/64/7/2545.pdf
http://medind.nic.in/iau/t03/i1/iaut03i1p25.pdf
http://www.scielo.br/pdf/bjm/v39n4/arq01.pdf
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16SRNA文献很多阿,你肯定没有好好找。我给你GOOGLE了一下:最后那篇是说菌种鉴定的。
http://aem.asm.org/cgi/reprint/64/7/2545.pdf
http://medind.nic.in/iau/t03/i1/iaut03i1p25.pdf
http://www.scielo.br/pdf/bjm/v39n4/arq01.pdf
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2045242/
细菌的16sRNA编码序列就在DNA上,又没有内含子,所以直接提取DNA,做PCR就可以测序了。不需要提取RNA。这样比较简单直接。
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