sars冠状病毒

篇一：SARS冠状病毒PLpro蛋白酶的结构

学年论文（设计）

（本科）

学 院 专 业 年 级 姓 名 论文（设计）题目冠状病毒PLpro蛋白酶的结构 指导教师 成 绩

2014 年 10月 19 日

目 录

摘 要……………………………………………………………………………1 关键词………………………………………………………………………………………1 Abstract…………………………………………………………………………………… 1 Key Words…………………………………………………………………………………1 前言………………………………………………………………………………………………1

一 SARS冠状病毒nsp3蛋白的拓扑学……………………………………2

二 SARS冠状病毒PLpro蛋白酶结构……………………………………2

1、PLpro单体结构……………………………………………………………3

2、PLpro催化位点的结构……………………………………………………3

3、PLpro催化位点的结构………………………………………………………3

四 结语………………………………………………………………………………4 参考文献……………………………………………………………………………4

SARS冠状病毒PLpro蛋白酶的结构

姓 名： 学号：

院 系： 专业：

指导老师： 职称：

摘要： SARS冠状病毒基因组编码，2种病毒蛋白酶,即木瓜样蛋白酶(PLpro)和3C样蛋白酶.其中,PLpro蛋白酶结构与功能研究是近年来冠状病毒分子生物学研究的热点之一.PLpro蛋白酶参与SARS冠状病毒1a(1ab)复制酶多聚蛋白N端部分的切割加工,是SARS冠状病毒复制酶复合体(RC)形成的重要调节蛋白分子.

关键词：SARS冠状病毒;PLpro蛋白酶

Abstract ：Severe acute respiratory syndrome(SARS) coronavirus genome encodes two viral proteases: a papain-like protease (PLpro) and a 3C-like protease (3CLpro). PLpro has

proteolytic activity in the cleavage and processing of N-terminals of replicase protein pp1a(pp1ab) to release the processed products of nonstructural proteins 1 to nsp3, which plays an important regulatory role in assembling of SARS coronavirus functional replicase complex (RC) on intracellular membrane.

Key words ：SARS coronavirus; papain-like protease

前言：

SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒是2003年新出现的引起人类急性呼吸道综合症的一种高致病性呼吸道病原,由WHO命名,感染死亡率约10%.虽然通过病例隔离等强有力公共卫生措施扑灭SARS冠状病毒感染后直至目前无感染病例出现,但由于SARS冠状病毒传播的中间宿主(果子狸和蝙蝠等)的存在,还无法预测SARS病毒是否还会在人类中再出现.SARS冠状病毒基因组是2917 kb的正义单链RNA,基因组的前2/3部分翻译2个大的复制酶多聚蛋白pp1a 和pp1ab.在木瓜样蛋白酶和3C样蛋白酶作用下,将其切割成16个非结构蛋白nsp1 ~16 ,经组装产生1个多功能、膜结合的复制酶复合体,由复制酶复合体介导完成病毒基因组的复制和结构基因的转录翻译.不同于其他大多数冠状病毒, SARS冠状病毒只编码1个PLpro. SARS PLpro特异性识别多聚蛋白pp1a N端nsp1~2、nsp2~3和nsp3~4之间的LXGG序列,参与1a复制酶蛋白N端的切割加工并释放成熟产物nsp1, nsp2和nsp3.SARS冠状病毒PLpro蛋白酶由其基因组的非结构基因nsp3编码,其基本生物学活性为蛋白酶活性.

1 SARS冠状病毒nsp3蛋白的拓扑学

SARS冠状病毒表达2个大的复制酶多聚蛋白,病毒编码的蛋白酶可将复制酶多聚蛋白切割成16个成熟的非结构蛋白(nsp).其中nsp3编码的PLpro蛋白酶负责切割释放nsp1、nsp2和nsp3.其它非结构蛋白都是由nsp5编码的3C样蛋白切割而来.水解产生16个切割产物聚集在一起形成膜结合的复制酶复合体.虽然复合体如何组装还是个未知的问题,但可确定非结构蛋白(nsp)中的跨膜成员负责复制酶复合体在膜上的定位.在冠状病毒16个非结构蛋白中已预测nsp3、nsp4和nsp6为跨膜蛋白.nsp3的3个疏水结构域中只有2个跨膜, nsp6的7个疏水结构域中6个跨膜, nsp4的4个疏水结构域全部定位在脂双层上.其中, nsp3和nsp6的保守非跨膜疏水结构域的存在提示此结构域在冠状病毒复制中可能会行使重要功能,但具体功能还有待进一步研究.

在nsp1~nsp16中, 213 kD的nsp3是最大的非结构蛋白. nsp3编码7个小的结构域nsp3a~ nsp3g.其中, nsp3a(1~183)含有1个泛素样折叠

结构(UB1)并通过对单链RNA的亲和力来结合RNA,其C末端含有1个富含酸性氨基酸残基的区域AC; nsp3b ADRP (ADP-ribose-1d-phosphatase)是一种多聚

ADP核糖结合蛋白,并具有ADP核糖-1d-磷酸酶的活性; nsp3c又称为SUD(SARS-unique domain),其C末端具有结合核酸的活性,而核心结构SUD-M (513~651)可结合单链PolyA并识别带有这类RNA的蛋白表面接触区. SUD-M的立体结构与nsp3b和一些解旋酶高度相似,但一级结构和功能差异很大; nsp3d 含有泛素相关折叠域和PLpro蛋白酶,参与pp1a与pp1ab的蛋白水解. nsp3有2个跨膜域,分别定位在nsp3a~nsp3e和nsp3g上.这种拓扑结构使nsp3蛋白定位在内质网膜上,和其他非结构蛋白共同形成复制酶体,完成病毒复制.

2 SARS冠状病毒PLpro蛋白酶结构

（1） PLpro单体结构

PLpro蛋白酶核心结构域一级结构氨基酸序列位于1541~1855(参考SARS Urbarni毒株,氨基酸编号从1a(1ab)第1个起始).分析发现[5],与蛋白酶活性相关的氨基酸位点为C1651, H1812和D1826,形成特征性的Cys-His-Asp三联守性、与酶催化活性密切相关的氨基酸位点在PLpro蛋白酶结构与功能中的作用,已通过酶高级结构的解析逐步明了.PLpro单体由4个不同氨基酸残基.通过对多种人类和动物冠状病毒PLP蛋白酶氨基酸序列比对分析发现, PLpro蛋白酶核心结构域中存在2个保守性的锌离子结合半胱氨酸(Cys)位点和1个保守性氧负离子洞谷氨基酸位点(Q).对于这些保结构域组成(Fig. 2),最开始的62个氨基酸形成1个独立的泛素样N末端结构域.其余3个组成1个伸展的右手结构包括掌心、拇指和指形结构域.掌心区由6股B片层组成,片层倾斜入拇指与掌心区之间的活性缝隙中;拇指区由4个突出的单环形成;而指形区由4股扭曲的反平行B片层组成,指尖结构域的2个B发夹结构含有4个半胱氨酸残基,与1个锌离子整合形成四面体结构,生化实验和生物信息学预测都显示了冠状病毒PLpro这个锌结合结构域的存在,通过对锌整合的半胱氨酸进行突变分析发现, PLpro结合锌的能力对其结构的完整和蛋白酶活性是必需的。

（2） PLpro催化位点的结构

PLpro的催化位点包括半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸残基.起催化作用的半胱氨酸位于拇指区的第4个突环上并与位于掌心区的组氨酸相距317!.天冬氨酸

篇二：新冠状病毒-类SARS病毒

新冠状病毒-类SARS病毒

新冠状病毒-类SARS病毒传播途径不明 ，已致1人死亡，世卫未发旅行警告

综合外国媒体报道，总部位于瑞士日内瓦的世界卫生组织当地时间9月24日发布公告称，一名感染了类似严重急性呼吸综合征（又称传染性非典型肺炎，简称SARS）病毒的卡塔尔男子目前正在英国接受特别治疗。此前，已有一名沙特籍男子因感染相同病毒而死亡。

感染者曾经前往沙特旅游，全球只确认两病例

世卫组织表示，这名卡塔尔男子现年49岁，曾前往沙特旅游。本月3日，他在回到卡塔尔后出现了发烧和呼吸困难等SARS症状。此后，他住进了卡塔尔首都多哈一个重症监护室。11日，他又被紧急转送至英国伦敦接受治疗。

患者被确认感染了一种新型冠状病毒，冠状病毒的种类有很多，引起普通感冒的病毒和引起SARS的病毒都属于冠状病毒。

不久之前，一名60岁的沙特男子也因感染冠状病毒死亡。英国科学家进行比对后发现，他死后肺部组织分离出的病毒基因序列，与这名卡塔尔患者的病毒基因序列几乎完全一致。两人临床表现都是急性呼吸道感染合并急性肾衰竭。22日，英国卫生管理机构向世卫组织通报相关情况。

目前，还没有证据表明该病毒能够在人与人之间进行传播，包括医护人员在内的所有接触者均未出现疑似感染症状。不过，英国卫生专家透露，接诊医院已经对这名卡塔尔男子进行了“严格的隔离”，负责护理的医护人员也都佩戴了防护设备。

科学家们对这一病毒的危险性还不确定。美国明尼苏达大学流感专家奥斯特赫姆说：“这种新型病毒是会演变成另一场SARS，还是就悄无声息消失、没有什么危害，我们都不清楚。”

英国、沙特和卡塔尔等国的卫生部门开展的初步调查显示，上述两名患者均为个案。因此，世卫组织并未对沙特或卡塔尔等国发出旅游警告，不过该组织同时担忧，由于下个月将开始一年一度的麦加朝圣活动，可能会为病毒传播提供可乘之机。

按世卫组织的说法，卡塔尔男子9月3日就医并确诊患有急性呼吸道感染，但没有交代这一诊断出自哪个国家的医生。9月7日，这名男子在卡塔尔首都多哈一家医院的重症监护室接受治疗，11日经由飞机转送至伦敦。世卫组织和英国方面都没有说明这名男子为何会转院至英国。

2003年爆发的SARS席卷全球30多个国家和地区，导致800多名感染者死亡，死亡率接近10%，引起了人们的普遍恐慌。

冠状病毒为圆形或椭圆形有膜单股正链核糖核酸（RNA）病毒，为基因组最大的RNA病毒，属有壳病毒目冠状病毒科；分为3个抗原群，其中Ⅰ群和Ⅱ群的宿主为哺乳动物，Ⅲ

群的宿主为禽类。随着细胞培养和分子生物学技术的发展，新型人冠状病毒HCo-NL63和HCoV-KKU1相继被发现。

HCoV-NL63于2004年首次被报道，属于冠状病毒Ⅰ群。随后，该病毒被全球多地报道从呼吸道感染样本中检测出，提示该病毒在呼吸道感染性疾病众多病原体中占有不可忽略的地位。该病毒感染者以婴幼儿居多，感染症状较温和，此外，成人中存在免疫缺陷者亦较容易被感染。HCoV-NL63感染时多合并其他呼吸道病毒的感染，其中常见的是呼吸道合胞病毒(RSV)及副流感病毒3型(PW3)。然而，单一HCoV-NL63感染者其病毒载量较合并感染者高。

HCoV-NL63病毒感染后可出现发热、咳嗽、咽痛和鼻炎等临床症状。感染幼儿可表现为下呼吸道疾病，以支气管肺炎及毛细支气管炎多见，同时可伴随腹痛、腹泻等消化道症状。一项研究发现，HCoV-NL63感染可导致哮喘加剧，高热、惊厥的发生。加拿大报道一名老人在感染发病5天后死亡，表明该病毒在特定人群中可能危害严重。值得注意的是，多项研究表明HCoV-NL63感染与喉炎的发生有关。该病毒对于婴幼儿、免疫缺陷患者及某些器官功能不全的患者可能带来严重后果，应引起重视。

HCoV-HKU1属于第2群冠状病毒。HCov-HKU1具有季节性，高峰在晚秋、冬季，其在人群中的感染率明显低于其他呼吸道冠状病毒。其感染症状也相对轻微，但对于有基础疾病和免疫抑制的患者，会加重症状并引起严重的呼吸道疾病。

陈伟师介绍，冠状病毒通过呼吸道分泌物排出体外，经唾液、喷嚏、接触传染，并通过空气飞沫传播。该类病毒对热敏感，紫外线、来苏水、0.1%过氧乙酸及1%克辽林（煤焦油皂溶液）等都可在短时间内将病毒杀死。

陈伟师认为，传染病的早期控制重在早发现，故基层医生应对此类传染病有正确认识，既不可恐慌失措，亦不能掉以轻心。当在接诊有发热、咳嗽等呼吸道感染的患者时，应注意详细询问，近期是否有赴阿拉伯半岛地区（尤其是沙特阿拉伯王国和卡塔尔）旅行史、在当地的动物接触史以及归国后的密切接触史等情况。若按常规感冒治疗1周后症状未改善，或出现呼吸困难、肾衰竭等表现，应马上将患者隔离，采取更积极的治疗。

目前，世界卫生组织（WHO）通报的来自中东的新型冠状病毒确诊的病例数少，国内尚未有疑似病例报告，但全球化的脚步，也加快了疾病传播的速度。基层医生应当对这类传染性疾病提高警惕，严防疾病扩散。

预防新型病毒感染五要点

根据WHO的指引，中国疾控中心近日发布了对新型病毒预防的几点措施。基层医生也应有所了解，告知患者注意。

1.尽管现有资料提示新型冠状病毒并不容易在人与人之间传播，但前往阿拉伯半岛国家的人员仍应尽量减少前往人群拥挤的场所（尤其是密闭场所）并长时间停留。

2.目前，新型冠状病毒感染的传染源、储存宿主等尚不清楚，不排除病毒通过动物感染

人类的可能性。因此，前往上述国家（尤其是沙特阿拉伯）的人员应尽量避免前往动物饲养、屠宰、生肉制品交易场所以及野生动物栖息地；避免直接接触动物及动物的排泄物。

3.应保持良好的个人卫生习惯和环境卫生；做到勤洗手，避免用手直接触摸眼睛、鼻或口；尽量避免密切接触有呼吸道感染症状人员（如发热、咳嗽、流涕等）；若当地有呼吸道传染病流行，外出时应尽量佩戴口罩。

4.当个人出现呼吸道感染症状时，应及时就医。患病期间应尽量避免与其他人员密切接触，近距离接触他人时应戴口罩；咳嗽或打喷嚏时用纸巾、毛巾等遮住口鼻，并将污染的纸巾妥善弃置；打喷嚏、咳嗽或清洁鼻子后应彻底洗手。参加团体旅行活动者，建议终止旅行或暂时脱离旅游团队，进行自我隔离休息，避免传染给团队内其他人员，并密切观察自身健康状况。

5.旅行期间应注意保持均衡饮食，充足休息，保持良好的身体状况，避免过度劳累；注意饮食卫生；居住或出行时应保持室内或交通工具内空气流通。年龄较大人群、有基础疾病的人群尤其应当注意自身健康。

新冠状病毒不同于SARS 中国尚无病例

邓海华指出，9月，沙特阿拉伯和英国先后报道了两例新型冠状病毒引发的散在感染病例，世界卫生组织已经证实这个新冠状病毒和2003年流行的SARS病毒是不一样的，目前也没有证据表明已经造成了人员之间的传播。目前为止中国没有报道新型冠状病的病例，全球也没有新增加感染的病例。

境外疫情发生以后，卫生部高度重视，并成立了新型冠状病毒防控应急领导小组，负责指挥协调卫生系统内部的相关工作，包括收集相关的信息，如病原学、疾病防控、卫生救治等等，对信息加工整理，组织专家进行风险评估。同时指导各地开展新型冠状病毒感染相关病例的监测、排查、报告工作。

邓海华称，现在中国疾病控制中心已经具备了实验室检测能力，我们也对全国32个省级和131个口岸城市的疾控机构和检验检疫机构，包括400个网络实验室进行冠状病毒实验室检测技术培训。在“两节”期间卫生部牵头成立了跨部门、跨区域的应对新型冠状病毒疫情的协作机制，制定了工作方案、应急预案和诊疗技术指南，并且配合国家质检总局、国家宗教局制定了口岸和朝觐人员的疫情防控预案，积极落实相关措施。

同时在中国疾病预防控制中心的网站上发布了新型冠状病毒的国际旅行健康提示。卫生部将进一步强化部门之间的合作，按照预案的要求，落实各项防控措施，进一步完善相关的技术方案，同时加强培训和演练，指导各地，尤其是朝觐人员出入境口岸城市卫生部门做好疫情防范和应对的准备工作。

篇三：新冠状病毒和SARS惊人相似,哪个致命率更高？

2013年5月8日，法国发现首例感染新型冠状病毒的确诊病例。截止6月2日公布的新数据已造成55人感染、33人死亡。

? 类似于SARS，那么谁的致命率高？

据国外媒体报道， 一个国际医生团队在对沙特近期爆发的中东呼吸系统综合征

（MERS）冠状病毒进行研究后，发现新冠状病毒致死率超过50%！这一数据与10年前的SARS和最近的H7N9病毒比起来，更令人心惊肉跳。近日，这种已在多国出现的新病毒被贴上了一个恐怖标签———“类SARS”病毒。

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（电子显微镜下的中东呼吸系统综合征冠状病毒）

(转载于:www.smhaida.com 海 达 范 文网:sars冠状病毒)

该团队在对沙特东部20余例MERS冠状病毒病例研究后发现，这种病毒与2003年爆发的SARS病毒有很多惊人的相似点，在中东和欧洲一些国家传播。但与SARS不同的是，医生们至今对该病毒的来源了解甚少。

令人担忧的是，该团队发现这种新病毒不仅能在人群间轻易传播，而且在医院内也能传播。该团队的一名资深流行病学专家佩尔表示，新病毒的传播特征与SARS类似。但他们仍无法准确追踪每个病例的传染来源。

佩尔说，他们尚无法确定新病毒是通过咳嗽、打喷嚏还是其它间接的途径进行传播的，因为医院里有些病人并未接近MERS冠状病毒携带者，但也不知以何种方式被感染了。

与SARS8%的死亡率比较，MERS冠状病毒显示出更高的致死率，其死亡率在沙特高达65%。不过，由于一些轻微病状的病人可能没被统计在内，会对最终的数据产生一定影响。

来自：搜狐

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? 如此高的致命率，什么都不多说，赶紧看看解决方法

1、消毒措施

一些普通消毒剂就能在5分钟内杀死“非典”病毒，它们包括：丙酮;10%甲醛和多聚甲醛溶液；10%次氯酸钠溶液;75%乙醇和2%苯酚的混合溶液。此外，56摄氏度以上的高温可以在半个小时内杀死病毒。

2、良好习惯

家内

作为一种传染性疾病，非典有其传染源、传播途径和易感人群。针对前两者，勤洗手显得格外重要。吃饭之前、触摸自己的口、眼、鼻之前等一定要洗手，打喷嚏、咳嗽时应该用手帕或者纸巾遮掩，再清洁手部，洗手后用一次性的纸巾抹干。

室外

疫情严重时期尽量减少到公共场所的次数;乘坐公交车时最好坐在通风处，如果车辆拥挤，尽量改乘其它车辆;乘坐出租车时注意消毒日期是否是当天更新的。

新型冠状病毒结构图

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篇四：微生物学理论指导：SARS冠状病毒(SARS-CoV)的致病性及防治原则

1.致病性：冠状病毒属内有20多种病毒。主要为感染脊椎动物的病毒，其中能感染人的冠状病毒分为三个组别。Ⅰ组：引起上呼吸道感染和普通感冒及婴幼儿间质性肺炎的病毒，代表毒株229E；Ⅱ组：引起新生儿和婴幼儿急性腹泻和胃肠炎的病毒，代表毒株OCA3株；III组，为2003年?a href="http://www.zw2.cn/zhuanti/guanyuluzuowen/" target="_blank" class="keylink">路⑾植⒚腟ARS冠状病毒（SARS-CoV），引起具有流行性的严重疾病即急性呼吸综合征（简称sARs）。

SARS-CoV主要经呼吸道传播，亦可经手接触及其他密切接触传播，还有可能经粪-口传播。潜伏期平均3～7日，主要侵犯肺、脾和淋巴组织细胞，引起呼吸窘迫综合征和免疫力低下。病死率约为14%。

2.防治原则：目前缺乏针对病原学的特异预防和治疗方法，预防性疫苗处于研究阶段。 预防SARS流行的关键是早期隔离患者及医学检疫可疑患者。在医院应建立健全防控医院感染的制度和措施，对室内环境进行必要的消毒和灭菌措施，以切断传播途径。SARS患者及可疑患者的标本，应专送生物安全三级（BsL-3）实验室检验与研究。

篇五：SARS病毒

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SARS病毒的背景和初步分析

我国称为非典型肺炎的严重急性呼吸综合征（Severe Acute Respiratory Sydrome，SARS）已经在22个国家和地区发生。据介绍，截至4月27日10时至28日10时，全国内地共报告新增非典型肺炎临床诊断病例203例(其中医务人员36例)，治愈出院7例，死亡9例。其中北京96例(其中59人为新发病例，37人为疑似病 例转为临床诊断病例)，死亡3例；河北3例，死亡3例(此3例死亡病例为昨日数据，今日补记)；山西29例，出院1例，死亡1例；内蒙古38例，死亡1例；河南1例；湖北1例；广东13例，治愈出院6例；甘肃1例，死亡1例。截至4月28日10时，全国内地共累计报告非典型肺炎病例3106例(其中医务人员653例，北京排除既往临床诊断病例11例)，治愈出院1306例，死亡139例。4月27日10时至28日10时，各地还报告新增非典型肺炎疑似病例290例。其中北京149例；天津12例；河北8例；山西29例；内蒙古24例；黑龙江1例；上海1例；浙江1例；安徽1例；河南3例；湖北2例；湖南1例；广东51例；重庆1例；四川4例；陕西2例。截至4月28日10时，全国内地非典型肺炎疑似病例累计为2106例。世界卫生组织（World Health Organization，WHO）迅速建立起由全球10个国家的13个实验室组成的协作研究和监测网络（见附录一）。研究发现，一种新型的冠状病毒极可能是病因，但也有可能有其他协同因素如hMPV（human metapneumovirus）使病情恶化，在香港和加拿大的病人和死亡病人的尸体中都分离出了这种病毒，在一些SARS病人的血清中也发现了抗hMPV的抗体。4月16日，WHO正式确认 SARS病毒是SARS的病因。96%感染SARS病毒的人能够自愈。病毒在从SARS自愈的人的血清中生长缓慢，说明人体可以针对病毒产生抗体。美国USAMRIID（U.S. Army Medical Research Institute of Infectious Diseases）正着手试验几千种经过FDA批准过的药物，以寻找能够治疗SRAS的药物。

1．初步的临床描述：

（1）潜伏期：2-7天。患者通常有高于 38 度的发热，并会伴有寒颤，或者其他如：头痛，倦怠和肌痛。典型的病例通常不会有皮疹，神经系统症状和肠胃系统的症状。少数比例报道有腹泻。

（2）下呼吸道期：3-7天以后，病程进入此期。干咳无痰，呼吸困难，甚至低氧血症（呼吸困难，紫绀，缺氧早期心动过速，血压升高，严重时出现心动过缓，血压下降，甚至休克），患者通常都需要气管插管或者呼吸机维持。

（3）血象：绝对白细胞计数减少，血小板减少。病程早期有肌酸磷酸激酶水平升高，肝转氨酶水平升高。

（4）治疗：目前没有特效治疗方法。

（5）预防：

勤洗手

保持环境卫生和空气流通

避免到人群聚集或空气不流通的地方

避免不必要的探病

均衡饮食

适量的休息和运动，增强抵抗力

SARS病毒为正链的单链RNA病毒，复制不经过DNA中间体，使用标准密码子。在分类学上的地位是： ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage; Nidovirales; Coronaviridae; Coronavirus; SARS coronavirus

SARS病毒相关研究文献

SARS蛋白质以及人体中与之可能相互作用的蛋白

SARS病毒的相关序列：

Sequence downloaded

SARS病毒的酶切图谱：

酶切图谱下载

SARS病毒的表位分析初步结果

SARS病毒的序列编码预测

SARS病毒编码的蛋白质序列（FASTA格式）

冠状病毒属蛋白分类表

对SARS病毒的研究结果总结：

SARS病人的呼吸道切片和细胞培养物的电子显微镜照片显示，冠状颗粒；

SARS病毒可以和I群冠状病毒的多克隆抗体发生反应；

这是一种新型的冠状病毒，与冠状病毒属中其他已知的成员不同；

病毒引起VERO和FRhk-4细胞病变效应，病毒复制被SARS康复人的血清所抑制；

可以利用感染的细胞点和康复病人的血清进行免疫荧光检测法（Immunofluorescence assays，IFA ）检测培养细胞中细胞感染有病毒，都表现出很高水平的特异性反应。 反应从负到正，或者是在非直接的荧光反应中有诊断意义的升高。

美国、加拿大和香港的研究表明，非SARS病人的血清不能和新冠状病毒发生反应；

冠状病毒的通用引物发现SARS病人的切片和细胞培养物中发现新型冠状病毒；

传染性肠胃炎病毒（Transmissible Gastroenteritis Virus，TGEV）、鼠肝炎病毒（Murine Hepatitis Virus ，MHV）、猫传染性腹膜炎病毒（Feline Infectious Peritonitis virus，FIPV）、229E人冠状病毒的超抗血清可以抑制培养的病毒生长；

几个实验室对病毒的部分测序表明，新病毒和冠状病毒属相关，但不同于同属的其他3个群；

动物接种直言试验正在进行。

检测SARS病毒的方法：

现有诊断手段有3种，样品处理须在3级生物安全的条件下进行，病毒培养和动物试验需要在3+级的条件下进行：

1.抗体检测：ELISA（IGM/IGA）方法可以可靠地检出出现临床症状20天后SARS病人血清中的病毒抗体。某些病人在14-21天时，已经可以检测到抗体。免疫荧光法检测可以检测出病毒感染VERO细胞10天后产生的 M免疫球蛋白；

2.分子检测方法：已经发展了7对引物（见附录二）使用于检测过程中，检测中的阳性对照RNA可以从Bernhard-Nocht Institute in Hamburg, Germany免费获得。检测样品包括血液、粪便、呼吸道分泌物。PCR结果可以辅助临床诊断评价，但是不能肯定或排除疾病的可能；

3.细胞培养方法：利用VERO细胞来检测SARS病人的呼吸道分泌物和血液样品，阳性结果表示SARS病人感染了冠状病毒，阴性结果不表明病人不是SARS。

4月19日，军事医学科学院微生物及传染病研究所所长杜新安表示，除间接免疫荧光技术外，他们又发现三种快速检验SARS(非典型肺炎)的方法。目前他们正在夜以继日加紧研制开发有关诊断试剂。专家表示，新试剂会进一步缩短免疫荧光技术创造的两小时的检测时间。据悉，新方法包括使用PCR技术，PCR是一种体外基因复制技术，可在几十分钟内把基因扩增到数百万倍以上，使基因便於检测。据悉，新的检验方法将不局限于对血样的监测，痰液、唾液和漱口液也可成为快速检测的依据。自从快速检验SARS的消息公布以来，已有多家军、地医院送来血样，要求军事医学科学院协助检测。

基因组测序及分析：

目前美国（CDC，USA）和加拿大（BCCA Genome Sciences Centre, British Columbia Centre for Disease Control and National Microbiology Laboratory Canada）的实验室完成SARS病毒的基因组测序。比较二者已经公开的病毒全基因组序列，发现有很小的差异。美国Urbani株长度为29，727 nt，其5ˊ端多出一段TTATTAGGTTTTTAC（15nt）；加拿大病毒株长度为29，736nt，其3ˊ端多出24个A。相对于Urbani株，加拿大病毒株其他位置的差别依次为：

7919（T→C），16622（T→G），19064（G→A），19183（C→T），20596（A→G），20910（G→T），23220（T→G），24872（C→T），26857（C→T）。

除了这些差别，SARS病毒基因组与其他冠状病毒的结构相似。初步的基因组注释在NCBI完成，预测得到的主要蛋白质有RNA聚合酶蛋白（聚合酶1a, 1b），S蛋白（spike protein），E蛋白（small membrane protein），N蛋白（nucleocapsid protein）等。使用Clustalx 1.82，用 neighbor-joining tree方法构建的冠状病毒的进化关系树如下：

M蛋白：

N蛋白：

S蛋白：

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