PCR引物设计 5‘端富集GC 3’端少GC而且以T结尾 这样对吗

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/16 05:49:09

PCR引物设计 5‘端富集GC 3’端少GC而且以T结尾 这样对吗
PCR引物设计 5‘端富集GC 3’端少GC而且以T结尾 这样对吗

PCR引物设计 5‘端富集GC 3’端少GC而且以T结尾 这样对吗
这样还不错.5‘段增加稳定性,3’端最好不要有太多的GC,一般来说,最后5个碱基里不要出现超过2-3个G或者C.因为3‘端是扩增的关键,一旦出现3’端的错配或者二聚体,因为GC配对是较为牢固的,是难以解开的.就可能会造成非特异扩展.
但是我建议最后一个如果可以的话以G、C结尾.
其实以我的经验,设计引物的那些原则可以不要太讲究,毕竟能跑出来才是硬道理.跑得漂亮自然更好.对于有些复杂区域,本来就很难设计引物,勉强也在所难免.

最好以T结尾 不是一定 选打分高的。。。

对的,这样设计结合率高,PCR容易成功。但不一定非得按这个来,因为同时还得考虑其他因素,如错配,发卡结构,假阳性等,综合考虑选最优的。