已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/16 14:56:07

已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?

已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?
首先请上NCBI BLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.
若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物.比如你的蛋白质N端序列为
MTAGSR...
上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额)
下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3'
则下引物为 5'-NTC NTC-3'

不好意思!不是非常了解，不作答。

若搜索不到任何信息，就需要通过设计兼并引物。比如你的蛋白质N端序列为 常规PCR反应用于已知DNA序列的扩增，反应循环数为25 35，变性温度为94℃，复

已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物? 已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端如果N端序列为TNTPE请问下上游引物应为ACN AAY ACN CCN GAR 还是TGNTTRTGNGGNCTY? 各位高手请问一下Burkholderia菌是属于细菌,我可以用3'RACE方法扩增其全基因序列吗?引物怎么设计谢谢你的回答,不过我现在做的是Burkholderia产的脂肪酶的全基因扩增,通过酶的分离纯化后得到N 核苷酸序列转换蛋白质序列已知一个基因的核苷酸序列,如何将它转变成蛋白质序列? 如何扩增序列未知的基因片段 【生物化学题目】对应蛋白质N端的是基因序列的5端还是3端? 性染色体只存在于生殖细胞队吗?还有为什么pcR技术扩增目的基因前要已知一段目的基因的核苷酸序列呢 性染色体只存在于生殖细胞队吗?还有为什么pcR技术扩增目的基因前要已知一段目的基因的核苷酸序列呢 下列序列是一段cDNA序列,请利1.用生物信息学的方法得出其基因的全序列,列出该基因属于何物种,绘出该基因的结构,预测其ORF,并对其蛋白质序列进行分析(包括其属于哪个家族、初级结构、doma NCBI通过蛋白质序列寻找基因序列 已知蛋白质的氨基酸序列,如何求出编码该蛋白的基因序列 我只知道朗德鹅ACSL1基因的mRNA序列,不知道DNA序列,想扩增DNA序列,应该怎么设计引物呢? 已知某种蛋白质的mRNA序列,如何将其克隆 已知某通道蛋白的基因全序列,怎么找出编码膜内部分的序列? 如何通过已知的引物序列查询基因的全序列 目的基因序列已知,如何克隆其cDNA? 我是想扩增其侧翼序列,但是它整个序列AT含量很高,不知道怎么设计引物呢 我现在做克隆全基因序列方面的实验,已经得到了蛋白N-端部分序列,原本想通过3'RACE技术做的,但因为现在