各位高手,请教如何从体液中提取真菌DNA,用于测序?请推荐方法和试剂盒,谢谢
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/06 09:37:00
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现在均有现成的提取试剂盒,卖kit的公司有:大连宝生物;OMEGA;天根等;如果进行测序,那么在提取真菌DNA后,再采用下面的引物进行PCR扩增,得到目的片段后再进行测序.
Primer名称序列(5'to3')
ITS1TCCGTAGGTGAACCTGCGG
ITS4TCCTCCGCTTATTGATATGC
ITS5 GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG
普通细菌DNA一般采用16s rRNA上的通用引物进行PCR扩增,引物序列如下:
•27f 5'AGAGTTTGATCMTGGCTCAG
•342r 5'CTGCTGCSYCCCGTAG
•357f 5'CTCCTACGGGAGGCAGCAG
•519r 5'GWATTACCGCGGCKGCTG
•530f 5'GTGCCAGCMGCCGCGG
•1100r 5'GGGTTGCGCTCGTTG
•1114f 5'GCAACGAGCGCAACCC
•1392r 5'ACGGGCGGTGTGTRC
•1406f 5'TGYACACACCTCCCGT
•1492r 5'TACGGYTACCTTGTTACGACTT
•1525r 5'AAGGAGGTGWTCCARCC
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