限制性内切酶酶解中通常遇见什么问题
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/16 18:53:44
限制性内切酶酶解中通常遇见什么问题
限制性内切酶酶解中通常遇见什么问题
限制性内切酶酶解中通常遇见什么问题
(1)DNA完全没有被内切酶切割,由分析知,可能存在的原因有:内切酶失活,DNA不纯,含有SDS、酚、EDTA等内切酶抑制因子;条件不足,DNA酶切位点上的碱基被甲基化;DNA酶切位点上没有甲基化,DNA位点上存在其他修饰,DNA不存在该酶识别序列.
(2)DNA切割不完全,可能存在的原因有:内切酶活力下降,内切酶稀释不正确,DNA不纯,反应条件不佳;内切酶识别的DNA位点上的碱基被甲基化或存在其他修饰,部分DNA黏在管壁上,内切酶溶液粘度大,取样不准,酶切后DNA粘性末端退火;由于反应溶液温度、强烈震荡使内切酶变形;过度稀释使酶活性下降
(3)DNA片段数目多于理论值.可能原因:内切酶星状活力减少,其他内切酶污染
(4)酶切后没有观察到DNA片段存在.DNA定位错误,在酶切反应液中形成非特异的沉淀
(5)内切酶保存期内快速失活,保存温度不适,以稀释形式保存,贮藏缓冲液不适当,低蛋白浓度等
(6)电泳后DNA片段的带型弥散不匀,DNA上结合有蛋白质,内切酶中含有DNA外切酶
没切出来或星活性